Protein–RNA interactions for Protein: Q8K0H1

Slc47a1, Multidrug and toxin extrusion protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc47a1Q8K0H1 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Slc47a1Q8K0H1 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Cacna1i-202ENSMUST00000160424 9781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Adnp-201ENSMUST00000057793 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Flt1-202ENSMUST00000031653 6895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc47a1Q8K0H1 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms