Protein–RNA interactions for Protein: Q8K045

Pkn3, Serine/threonine-protein kinase N3, mousemouse

Predictions only

Length 878 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn3Q8K045 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkn3Q8K045 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Rnf207-201ENSMUST00000076183 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Pkn3Q8K045 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms