Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LgsnQ8CIX8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Mapt-202ENSMUST00000106988 2202 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Npffr1-201ENSMUST00000020287 3479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
LgsnQ8CIX8 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms