Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHX7

Rftn2, Raftlin-2, mousemouse

Predictions only

Length 500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rftn2Q8CHX7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Rftn2Q8CHX7 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
Rftn2Q8CHX7 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.2 ms