Protein–RNA interactions for Protein: Q8CH19

Csnka2ip, Casein kinase II subunit alpha'-interacting protein, mousemouse

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Length 720 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnka2ipQ8CH19 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Tm6sf2-201ENSMUST00000049197 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Csnka2ipQ8CH19 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
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Csnka2ipQ8CH19 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Csnka2ipQ8CH19 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
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Csnka2ipQ8CH19 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
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Csnka2ipQ8CH19 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Csnka2ipQ8CH19 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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