Protein–RNA interactions for Protein: Q8CDN8

Ccdc38, Coiled-coil domain-containing protein 38, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc38Q8CDN8 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ccdc38Q8CDN8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ccdc38Q8CDN8 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms