Protein–RNA interactions for Protein: Q8CD19

Lancl3, LanC-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lancl3Q8CD19 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Pik3ip1-202ENSMUST00000093399 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Ifi27-204ENSMUST00000079294 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Lancl3Q8CD19 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms