Protein–RNA interactions for Protein: Q8CCH2

Nhlrc3, NHL repeat-containing protein 3, mousemouse

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Length 347 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nhlrc3Q8CCH2 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Zbp1-201ENSMUST00000029018 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Parp3-203ENSMUST00000123555 2495 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Nhlrc3Q8CCH2 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Nhlrc3Q8CCH2 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
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