Protein–RNA interactions for Protein: Q8BY87

Usp47, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 47, mousemouse

Predictions only

Length 1,376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp47Q8BY87 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Krt23-201ENSMUST00000006969 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Usp47Q8BY87 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Wnt10b-206ENSMUST00000228546 2709 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Usp47Q8BY87 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms