Protein–RNA interactions for Protein: Q8BWP5

Ttpa, Alpha-tocopherol transfer protein, mousemouse

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Length 278 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TtpaQ8BWP5 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TtpaQ8BWP5 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
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TtpaQ8BWP5 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
TtpaQ8BWP5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.1 ms