Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVN3

Catsper4, Cation channel sperm-associated protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Catsper4Q8BVN3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Tsc22d2-201ENSMUST00000099090 9799 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Zfp12-201ENSMUST00000032591 5265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 4933435F18Rik-202ENSMUST00000154878 2174 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Catsper4Q8BVN3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms