Protein–RNA interactions for Protein: Q8BL06

Usp54, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 54, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,588 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp54Q8BL06 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Mycbpap-201ENSMUST00000040692 1512 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm17271-201ENSMUST00000165535 355 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Pantr2-201ENSMUST00000180589 463 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Zfp787-205ENSMUST00000207957 880 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm11745-201ENSMUST00000121669 448 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Thap4-205ENSMUST00000189728 713 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Zfp706-204ENSMUST00000226671 447 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Usp54Q8BL06 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Dusp3-205ENSMUST00000143177 391 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Usp54Q8BL06 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms