Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJ73

Rspo4, R-spondin-4, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rspo4Q8BJ73 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Rnase10-202ENSMUST00000164632 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ybx1-ps2-201ENSMUST00000201305 957 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Krtap19-4-201ENSMUST00000051103 304 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rspo4Q8BJ73 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.4 ms