Protein–RNA interactions for Protein: Q8BH66

Atl1, Atlastin-1, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl1Q8BH66 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Chuk-202ENSMUST00000119591 3481 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Atl1Q8BH66 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Atl1Q8BH66 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.5 ms