Protein–RNA interactions for Protein: Q8BGX0

Trim23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim23Q8BGX0 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Anxa2-201ENSMUST00000034756 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Homer2-206ENSMUST00000207983 1634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Cspp1-203ENSMUST00000118263 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trim23Q8BGX0 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
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