Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG15

Ctdspl2, CTD small phosphatase-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctdspl2Q8BG15 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ctdspl2Q8BG15 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ctdspl2Q8BG15 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms