Protein–RNA interactions for Protein: Q85ZW6

H2-M10.3, Histocompatibility 2, M region locus 10.3, mousemouse

Predictions only

Length 330 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M10.3Q85ZW6 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 1110004F10Rik-203ENSMUST00000106608 927 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
H2-M10.3Q85ZW6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.6 ms