Protein–RNA interactions for Protein: Q80Y84

Kdm5b, Lysine-specific demethylase 5B, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm5bQ80Y84 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Haghl-207ENSMUST00000140738 1194 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Gm45747-201ENSMUST00000212203 999 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Kdm5bQ80Y84 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Slc39a14-201ENSMUST00000022688 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Ttll9-202ENSMUST00000103155 1552 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Commd5-202ENSMUST00000109793 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm8344-201ENSMUST00000119813 856 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm12892-201ENSMUST00000117367 1146 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Kdm5bQ80Y84 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms