Protein–RNA interactions for Protein: Q80XJ3

Ttc28, Tetratricopeptide repeat protein 28, mousemouse

Predictions only

Length 2,450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc28Q80XJ3 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Zdhhc25-201ENSMUST00000066949 1368 ntAPPRIS P1 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Dtx3-204ENSMUST00000130855 1925 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Itgb5-201ENSMUST00000069345 3056 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm4899-201ENSMUST00000178708 719 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm26515-201ENSMUST00000181141 996 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
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Ttc28Q80XJ3 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Msrb2-201ENSMUST00000023856 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Ttc28Q80XJ3 Anapc15-204ENSMUST00000106973 650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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