Protein–RNA interactions for Protein: Q80WQ9

Zbed4, Zinc finger BED domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,168 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zbed4Q80WQ9 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Zbed4Q80WQ9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Olfr1564-201ENSMUST00000112162 1091 ntAPPRIS P2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
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Zbed4Q80WQ9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Zbed4Q80WQ9 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Zbed4Q80WQ9 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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Zbed4Q80WQ9 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Zbed4Q80WQ9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
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