Protein–RNA interactions for Protein: Q80VR2

Ell3, RNA polymerase II elongation factor ELL3, mousemouse

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Length 395 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell3Q80VR2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Fam222b-202ENSMUST00000100782 2473 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Rbm26-203ENSMUST00000163499 4212 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Btd-201ENSMUST00000090147 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Cadm2-203ENSMUST00000120898 2768 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Spryd3-203ENSMUST00000154032 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Zfp36-202ENSMUST00000209061 2465 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Ak1-203ENSMUST00000113278 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Ell3Q80VR2 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms