Protein–RNA interactions for Protein: Q80U57

Rims3, Regulating synaptic membrane exocytosis protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rims3Q80U57 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Kdf1-201ENSMUST00000042919 1708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gm26887-201ENSMUST00000181282 547 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Rims3Q80U57 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Rims3Q80U57 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.7 ms