Protein–RNA interactions for Protein: Q80TM9

Nisch, Nischarin, mousemouse

Predictions only

Length 1,593 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NischQ80TM9 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC33.61■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC33.61■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC33.6■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Trmt61a-201ENSMUST00000084947 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
NischQ80TM9 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC33.57■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC33.57■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC33.56■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Tssk3-201ENSMUST00000000421 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC33.55■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC33.54■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 1700086L19Rik-202ENSMUST00000185822 1028 ntTSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.52■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Rxfp4-201ENSMUST00000063119 1245 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
NischQ80TM9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Prr29-205ENSMUST00000190268 1141 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Gm35911-201ENSMUST00000198837 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Tpi1-205ENSMUST00000172132 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
NischQ80TM9 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
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