Protein–RNA interactions for Protein: Q80TJ7

Phf8, Histone lysine demethylase PHF8, mousemouse

Predictions only

Length 1,023 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf8Q80TJ7 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf8Q80TJ7 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf8Q80TJ7 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf8Q80TJ7 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf8Q80TJ7 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Phf8Q80TJ7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Thap12-201ENSMUST00000033009 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Pygo2-201ENSMUST00000060061 3198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Rspry1-202ENSMUST00000121101 3092 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Mef2d-204ENSMUST00000119251 3488 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Atf3-201ENSMUST00000027941 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Tulp3-201ENSMUST00000001562 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Hoxd3-203ENSMUST00000111983 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Rtn1-202ENSMUST00000078505 3629 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Lurap1l-201ENSMUST00000055922 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Id4-201ENSMUST00000021810 3849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Phf8Q80TJ7 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms