Protein–RNA interactions for Protein: Q7TSC1

Prrc2a, Protein PRRC2A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,158 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrc2aQ7TSC1 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Prrc2aQ7TSC1 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Lhb-201ENSMUST00000072453 678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Layn-204ENSMUST00000217212 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Fam3a-203ENSMUST00000114139 931 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Msantd1-204ENSMUST00000212362 798 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Prrc2aQ7TSC1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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