Protein–RNA interactions for Protein: Q7TN29

Smap2, Stromal membrane-associated protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smap2Q7TN29 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Smap2Q7TN29 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Smap2Q7TN29 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.9 ms