Protein–RNA interactions for Protein: Q7TMK9

Syncrip, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein Q, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 623 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SyncripQ7TMK9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
SyncripQ7TMK9 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
SyncripQ7TMK9 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms