Protein–RNA interactions for Protein: Q7M6Y2

Sox11, Transcription factor SOX-11, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox11Q7M6Y2 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Urah-204ENSMUST00000185612 716 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Urah-207ENSMUST00000211372 688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Urah-201ENSMUST00000026554 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm7616-201ENSMUST00000143112 624 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Dbi-207ENSMUST00000151708 491 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Coa3-201ENSMUST00000017332 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 CT009713.7-201ENSMUST00000224689 571 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 AV026068-213ENSMUST00000223675 1171 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Commd5-201ENSMUST00000068407 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Sox11Q7M6Y2 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms