Protein–RNA interactions for Protein: Q70IV5

Synm, Synemin, mousemouse

Predictions only

Length 1,561 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SynmQ70IV5 Tuba1c-201ENSMUST00000058914 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Arhgap27os1-201ENSMUST00000130556 923 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm14104-201ENSMUST00000135990 356 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm5186-201ENSMUST00000218781 920 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Lce1c-201ENSMUST00000047055 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 9430081H08Rik-201ENSMUST00000217460 818 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm5628-201ENSMUST00000222318 1049 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm20949-201ENSMUST00000206478 952 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Mdh2-201ENSMUST00000019323 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Rpph1-201ENSMUST00000175096 319 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SynmQ70IV5 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Cyb561d2-205ENSMUST00000195235 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Crygn-201ENSMUST00000047119 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Ccdc172-201ENSMUST00000069419 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Gm13306-202ENSMUST00000108018 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Bricd5-202ENSMUST00000164508 701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Plekhb1-202ENSMUST00000107043 931 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 2410006H16Rik-201ENSMUST00000131787 462 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Xrcc2-204ENSMUST00000134972 464 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Rprl2-201ENSMUST00000157150 290 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Rnf220-203ENSMUST00000102690 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Rnf138rt1-201ENSMUST00000059320 1191 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SynmQ70IV5 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.5 ms