Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZQM0

Rffl, E3 ubiquitin-protein ligase rififylin, mousemouse

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RfflQ6ZQM0 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Rcbtb1-201ENSMUST00000022551 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Cnot7-206ENSMUST00000135269 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gm37736-201ENSMUST00000193564 2802 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Miip-206ENSMUST00000172710 1769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Ripk3-203ENSMUST00000178399 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Muc3a-201ENSMUST00000179412 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Nelfa-201ENSMUST00000030993 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Shroom1-204ENSMUST00000109013 3312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Enah-212ENSMUST00000195059 2832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
RfflQ6ZQM0 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms