Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZPR5

Smpd4, Sphingomyelin phosphodiesterase 4, mousemouse

Predictions only

Length 823 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd4Q6ZPR5 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd4Q6ZPR5 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Smpd4Q6ZPR5 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms