Protein–RNA interactions for Protein: Q6W5C0

Cxcl3, C-X-C motif chemokine 3, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcl3Q6W5C0 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cxcl3Q6W5C0 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
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Cxcl3Q6W5C0 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
Cxcl3Q6W5C0 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cxcl3Q6W5C0 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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Cxcl3Q6W5C0 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Cxcl3Q6W5C0 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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