Protein–RNA interactions for Protein: Q6RHW0

Krt9, Keratin, type I cytoskeletal 9, mousemouse

Predictions only

Length 743 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt9Q6RHW0 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Olah-203ENSMUST00000194918 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Krt9Q6RHW0 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Gm44454-201ENSMUST00000198541 138 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Krt9Q6RHW0 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms