Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCX7

Rgma, Repulsive guidance molecule A, mousemouse

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RgmaQ6PCX7 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC15.05■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
RgmaQ6PCX7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Plekha8-202ENSMUST00000119706 6739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Kptn-201ENSMUST00000006178 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Atg7-215ENSMUST00000183165 2012 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
RgmaQ6PCX7 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.5 ms