Protein–RNA interactions for Protein: Q6P9L4

Usp49, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 49, mousemouse

Predictions only

Length 685 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp49Q6P9L4 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Usp49Q6P9L4 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Usp49Q6P9L4 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.4 ms