Protein–RNA interactions for Protein: Q6P4T0

Atg2a, Autophagy-related protein 2 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 1,914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg2aQ6P4T0 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Krt16-201ENSMUST00000007280 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Cnbp-202ENSMUST00000113617 952 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Izumo1r-203ENSMUST00000117620 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Cidea-201ENSMUST00000025404 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Atg2aQ6P4T0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Tbc1d7-202ENSMUST00000179852 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Atg2aQ6P4T0 Gm8909-203ENSMUST00000173353 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms