Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZP2

Gpbp1l1, Vasculin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gpbp1l1Q6NZP2 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Fbxo17-201ENSMUST00000032818 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm11788-201ENSMUST00000142520 562 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gldnos-201ENSMUST00000149237 841 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Cdk7-205ENSMUST00000225990 1159 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 AC132467.2-202ENSMUST00000227726 559 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Olfr370-201ENSMUST00000058609 1096 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif3b-201ENSMUST00000100507 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Mdk-204ENSMUST00000111309 771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Rab11fip4os2-201ENSMUST00000123067 689 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm38319-201ENSMUST00000194537 1266 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam162a-201ENSMUST00000004057 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Fkbp10-202ENSMUST00000107400 1467 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 1700037H04Rik-202ENSMUST00000103188 1241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gemin7-204ENSMUST00000122055 609 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 AC125350.2-201ENSMUST00000224737 727 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Gpbp1l1Q6NZP2 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms