Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZC7

Sec23ip, SEC23-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec23ipQ6NZC7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Lpgat1-201ENSMUST00000110855 7233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Sec23ipQ6NZC7 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms