Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWW9

Fndc3b, Fibronectin type III domain-containing protein 3B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc3bQ6NWW9 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Elof1-203ENSMUST00000213233 810 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Fndc3bQ6NWW9 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 AC093926.2-201ENSMUST00000214468 1228 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 A130006I12Rik-201ENSMUST00000091396 408 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Aanat-205ENSMUST00000153476 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Nphp1-201ENSMUST00000028857 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Fndc3bQ6NWW9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms