Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFZ6

Krt77, Keratin, type II cytoskeletal 1b, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt77Q6IFZ6 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Tprn-201ENSMUST00000114336 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Krt77Q6IFZ6 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Barhl1-201ENSMUST00000050776 3666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Cacnb4-201ENSMUST00000078324 8225 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Krt77Q6IFZ6 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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Krt77Q6IFZ6 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
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