Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZS6

Sv2c, Synaptic vesicle glycoprotein 2C, mousemouse

Predictions only

Length 727 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sv2cQ69ZS6 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Gm14822-201ENSMUST00000122247 291 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Dap3-202ENSMUST00000107491 1375 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Fam161a-205ENSMUST00000172602 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Sv2cQ69ZS6 Tstd3-201ENSMUST00000029915 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Gdap1l1-203ENSMUST00000109421 1206 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Vsig2-206ENSMUST00000215957 851 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 4930428E07Rik-201ENSMUST00000222132 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Pmm1-202ENSMUST00000071462 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Sv2cQ69ZS6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms