Protein–RNA interactions for Protein: Q69ZL1

Fgd6, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 1,399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fgd6Q69ZL1 Cmtm5-201ENSMUST00000037814 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Ercc8-202ENSMUST00000120672 1144 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm45711-202ENSMUST00000164175 979 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 2410004P03Rik-203ENSMUST00000190691 953 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 1700060J05Rik-201ENSMUST00000138377 1060 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Hoga1-204ENSMUST00000172244 631 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Lsamp-207ENSMUST00000189229 637 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Lsamp-210ENSMUST00000191610 1297 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm37277-201ENSMUST00000194052 1111 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm9385-201ENSMUST00000117563 472 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 AC155937.1-201ENSMUST00000125635 831 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Haglr-202ENSMUST00000152462 443 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Rab40c-203ENSMUST00000164982 789 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Kansl3-206ENSMUST00000187628 336 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Reep6-201ENSMUST00000040081 850 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 0610010K14Rik-204ENSMUST00000102569 778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Tpi-rs5-201ENSMUST00000216947 774 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 AC122024.2-201ENSMUST00000220086 871 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 S100a13-201ENSMUST00000048138 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm27618-201ENSMUST00000183671 60 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Prrg2-207ENSMUST00000210500 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Psrc1-201ENSMUST00000090561 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm3054-201ENSMUST00000111075 265 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Khdc3-202ENSMUST00000167514 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Apobec2-201ENSMUST00000046549 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Fgd6Q69ZL1 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Krtap1-3-201ENSMUST00000104930 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Pard6a-202ENSMUST00000098444 1273 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Fgd6Q69ZL1 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms