Protein–RNA interactions for Protein: Q68FD9

Kiaa1549, UPF0606 protein KIAA1549, mousemouse

Predictions only

Length 1,940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Krtap9-3-201ENSMUST00000062683 759 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 2810013P06Rik-201ENSMUST00000186531 2137 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Utp3-201ENSMUST00000090413 1629 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.11□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Kiaa1549Q68FD9 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.1□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.4 ms