Protein–RNA interactions for Protein: Q68EF0

Rab3ip, Rab-3A-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rab3ipQ68EF0 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Foxo3-203ENSMUST00000105502 6848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Pdzrn3-201ENSMUST00000075994 4104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Dnm1-204ENSMUST00000113352 4605 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Itga8-201ENSMUST00000028106 5812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Mgll-203ENSMUST00000113582 1034 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gm45168-202ENSMUST00000206461 1069 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Gm10584-201ENSMUST00000207036 2628 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Rab3ipQ68EF0 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm11627-202ENSMUST00000107081 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Zfp125-203ENSMUST00000208744 928 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Rab3ipQ68EF0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms