Protein–RNA interactions for Protein: Q66JY6

Arhgef39, Rho guanine nucleotide exchange factor 39, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgef39Q66JY6 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Tgfb1i1-205ENSMUST00000165667 1812 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Pdk1-201ENSMUST00000006669 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Taf6l-206ENSMUST00000176610 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Arhgef39Q66JY6 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms