Protein–RNA interactions for Protein: Q66JV7

Uncharacterized protein C8orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q66JV7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Lmnb1-201ENSMUST00000025486 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Q66JV7 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Q66JV7 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Des-201ENSMUST00000027409 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Q66JV7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q66JV7 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q66JV7 Smyd4-201ENSMUST00000044530 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Q66JV7 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 D630044L22Rik-201ENSMUST00000181174 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Pdia3-201ENSMUST00000028683 2770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Q66JV7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Q66JV7 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms