Protein–RNA interactions for Protein: Q64518

Atp2a3, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a3Q64518 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 BC024978-204ENSMUST00000179391 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Rd3-203ENSMUST00000181512 1760 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Dand5-201ENSMUST00000065539 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Dbx1-201ENSMUST00000032717 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Atp2a3Q64518 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.8 ms