Protein–RNA interactions for Protein: Q640N1

Aebp1, Adipocyte enhancer-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Aebp1Q640N1 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Bola3-202ENSMUST00000120040 583 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gm17968-201ENSMUST00000194902 784 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Nagpa-201ENSMUST00000023911 2143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Zfp688-201ENSMUST00000106300 1015 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gm15655-201ENSMUST00000134649 440 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Avpi1-201ENSMUST00000018965 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 AC155714.1-201ENSMUST00000214033 956 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Rpl8-201ENSMUST00000004072 862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gm8189-202ENSMUST00000211035 2039 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Ddx39-201ENSMUST00000019576 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Snrnp25-201ENSMUST00000039601 821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Nudt6-208ENSMUST00000146324 1264 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Crxos-201ENSMUST00000098801 934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Aebp1Q640N1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.1 ms