Protein–RNA interactions for Protein: Q63ZW7

Patj, InaD-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 1,834 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PatjQ63ZW7 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Echdc2-201ENSMUST00000052999 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gm27300-201ENSMUST00000184085 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Gm27335-201ENSMUST00000184758 97 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
PatjQ63ZW7 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Gm19164-201ENSMUST00000210667 640 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Brsk2-202ENSMUST00000075528 2160 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Best4-ps-201ENSMUST00000129783 1380 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Gm26768-201ENSMUST00000181097 966 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Car7-201ENSMUST00000056051 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Gm20496-202ENSMUST00000173770 523 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Mir3113-201ENSMUST00000175478 76 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
PatjQ63ZW7 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms