Protein–RNA interactions for Protein: Q62559

Ift52, Intraflagellar transport protein 52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift52Q62559 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Nsmce3-201ENSMUST00000094331 5946 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Slit1-203ENSMUST00000169141 5673 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm11729-201ENSMUST00000124901 713 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Mgarp-201ENSMUST00000038154 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ift52Q62559 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms